BAM filer är binära format för sequencer läsare . De lagrar vetenskapliga nukleotid data i ett komprimerat format , blandning både i linje och icke-justerade läser tillsammans. De styrs med " bam2fastq " verktyg , en dator kommando som kommer installeras med många nukleotid - sekvensering program ( du kan också få det gratis . ) För att extrahera den icke-justerade läser från en BAM fil , då är allt du behöver för Windows kommandoraden . Instruktioner
1
Type " bam2fastq " i startmenyn sökfältet för att se till att du har verktyget ( du behöver inte öppna den . ) Om du inte gör det , få det gratis i Resources .
2
Type " cmd.exe " i startmenyn sökfältet . Klicka " cmd.exe " när det visas ovan . Detta öppnar fönstren kommandoraden
3
Type . " Bam2fastq - ojusterad FILELOCATION.bam " ( inga citationstecken ) i kommandofönstret
4
Ersätt . " FILELOCATION " med placeringen av BAM filen . Använd formatet C: . . \\ Mapp1 \\ Mapp2 \\ File.bam "
5
Hit " Enter " Detta kommer att dyka upp ett textfönster med den icke-justerade läser från just BAM fil < . br > Addera ditt
