Medan flera protokoll * kan * användas är det vanligaste protokollet för överföring av filer mellan UNIX och Linux -system
Secure Copy Protocol (SCP) , ett säkert skal (SSH) -baserat protokoll. Andra alternativ inkluderar SFTP (SSH File Transfer Protocol) som också är SSH-baserade och erbjuder fler funktioner och mindre säkra alternativ som FTP (filöverföringsprotokoll) och RCP (fjärrkopia). SCP och SFTP föredras emellertid för sin säkerhet.
