Windows 2000 stöder dessa tre huvudfilsystem:
1. fat32: Ett äldre filsystem, främst för kompatibilitet med äldre system.
2. ntfs (nytt teknikfilsystem): Windows NT:s ursprungliga filsystem, som erbjuder funktioner som säkerhetsbehörigheter, journalföring och större volymstöd än FAT32.
3. fat16: Ett äldre, mindre kapabel filsystem, till stor del ersatt av FAT32. Medan Windows 2000 kunde *läsa *från FAT16 volymer, citeras det mindre ofta som ett stöd *filsystem för att skapa volymer *.
