Filsystemet som innehåller de flesta operativsystemfiler är vanligtvis
root -filsystemet (ofta betecknad som `/` i Linux/Unix-liknande system och `C:\` i Windows). Det är här kärnkärnan, systembibliotek och viktiga systembinärer bor. Medan andra filsystem kan lagra * vissa * operativsystemrelaterade filer (t.ex. bytpartitioner), finns de allra flesta på rotfilsystemet.
