F-16 använder inte ett allmänt operativsystem som Windows eller Linux. Istället använder den ett
realtidsoperativsystem (RTO) . De specifika RTO:erna varierar beroende på F-16:s variant och dess uppdragssystemuppgraderingar, men de är äganderätt och inte nämnda offentligt. Dessa RTOSS är mycket specialiserade och optimerade för de krävande kraven i flygkontroll och vapensystem.
