Ja, Windows 9x (Windows 95, 98 och Me) förlitar sig starkt på DOS -rutiner för att ladda och fungera. Medan de har en 32-bitars skyddad läge kärna, startar de fortfarande från en 16-bitars DOS-kärna och använder många DOS-tjänster och API:er. Windows 9x-kärnan körs ovanpå MS-DOS, vilket innebär att den grundläggande beror på DOS-lagret för kärnfunktionalitet. Detta är en viktig skillnad mellan Windows 9X och de NT-kärnbaserade Windows-versionerna (NT 4.0, 2000, XP, etc.).