En stor nackdel med verktygsprogramvara är att
det kan vara resurskrävande . Detta innebär att det kan ta upp betydande bearbetningskraft, RAM och hårddiskutrymme, vilket potentiellt bromsar ner din dator, särskilt äldre eller mindre kraftfulla maskiner. Detta gäller särskilt om flera verktygsprogram körs samtidigt eller om verktygen är dåligt optimerade.