SDF (strukturdataformat) används främst för att representera de
kemiska strukturerna för molekyler . Det är ett allmänt använt filformat inom keminformatik och beräkningskemi. En SDF -fil kan innehålla en eller flera molekyler, var och en med dess tillhörande strukturell information och eventuellt ytterligare egenskaper.
Informationen som är kodad i en SDF -fil kan inkludera:
* Molekylär anslutning: Atomerna och bindningarna som utgör molekylen.
* atomtyper: Elementtypen för varje atom (t.ex. C, H, O, N).
* atomkoordinater (3D): Den rumsliga platsen för varje atom, vilket möjliggör visualisering av molekylens 3D -struktur.
* Molekylära egenskaper: Olika data associerade med molekylen, såsom molekylvikt, logp (Octanol-Water Partition Coefficient), Smiles String, Inchi Key, etc.
SDF-filer är vanligtvis textbaserade och använder ett specifikt format med rader som börjar med `> ` för att beteckna egenskaper och datablock som innehåller atom- och bindningsinformationen. Deras flexibilitet gör dem lämpliga för att lagra stora samlingar av molekylstrukturer och deras tillhörande data, vilket gör dem till ett populärt val för databaser och virtuella screeningapplikationer.
