Ljudinnehållet i Final Cut Studio 2 (som inkluderade Final Cut Pro 6, Soundtrack Pro och andra applikationer) bestod inte av ett enda, specifikt format, utan stöttade snarare en mängd ljudfilformat. Dessa var till stor del okomprimerade och förlustiga komprimerade format vanliga vid den tiden. Här är några viktiga:
* okomprimerad: AIFF (Audio Interchange -filformat) var ett vanligt val för dess höga trohet och kompatibilitet inom Apple -ekosystemet. WAV (WaveForm Audio File Format) stöds också, men kanske mindre utbredd än AIFF i ett främst Apple-fokuserat arbetsflöde.
* Lossy komprimerad: MP3 användes allmänt för sina mindre filstorlekar, särskilt för att importera befintlig musik eller ljudeffekter. AAC (Advanced Audio Coding) stöds också, vilket erbjuder bättre kvalitet än MP3 på jämförbara bitrater, men det var fortfarande en förlustig kompressionsmetod.
Final Cut Studio 2 arbetade med ljudfiler genom att hantera de underliggande uppgifterna oavsett den specifika behållaren. Programvaran skapade inte i sig * ett specifikt ljudformat; Det importerade, redigerade och exporterade ljud baserat på användarens val, ljudhårdvarans funktioner och destinationsformatet. Den slutliga exporten kan vara i något av ovanstående format, eller andra beroende på inställningar. Redigeringsprocessen fungerade själv med ljuddata, inte bara metadata om filen.