Fjärde generationens datorer, kännetecknade av användning av mikroprocessorer, hade flera nackdelar, av vilka några övervinns av efterföljande generationer, medan andra fortfarande är relevanta även i dag:
* Hög initialkostnad: Tekniken var relativt dyr att producera och köpa, vilket begränsade tillgången för många individer och mindre organisationer.
* Beroende av programvara: Medan mjukvaruflexibilitet var ett stort framsteg, blev beroende av komplex och ibland buggy mjukvara en sårbarhetspunkt. Systemolyckor, mjukvarufel och virus kan orsaka betydande störningar och dataförlust. Detta beroende innebar också att specialiserad expertis krävdes för att underhålla och driva systemen.
* Strömförbrukning: Även om de är effektivare än tidigare generationer, konsumerade de fortfarande en anmärkningsvärd mängd makt, särskilt jämfört med senare generationer. Detta var en faktor i både kostnad och miljöpåverkan.
* Limited Processing Power (relativt senare generationer): Jämfört med den rena bearbetningskraften hos senare generationer (femte, sjätte, etc.) hade fjärde generationens datorer begränsningar. Uppgifter som är vanliga idag skulle ha varit långsamma eller omöjliga på tidens teknik. Denna begränsning tillämpas på både hastighet och minneskapacitet.
* Värmeproduktion: Mikroprocessorer genererade betydande värme och krävde robusta kylsystem. Detta ökade till kostnad och komplexitet.
* Säkerhetssårbarheter: När programvaran blev mer sofistikerad, gjorde det sätt som det kunde äventyras. Säkerhet var ett växande problem och effektiva lösningar utvecklades fortfarande.
Det är viktigt att komma ihåg att det som ansågs vara en "nackdel" ofta var relativt den tekniken som var tillgänglig vid den tiden. Många av nackdelarna med fjärde generationens datorer behandlades genom framsteg inom miniatyrisering, kylteknik, bearbetningskraft, mjukvaruteknik och säkerhetsprotokoll i senare generationer.