Virus, viroider och prioner passar inte snyggt in i systemet med tre domäner (bakterier, archaea, eukarya). Tre-domänssystemet är en klassificering för * cellulära * livsformer. Virus, viroider och prioner är acellulära; De saknar den cellulära strukturen och maskinerna som är nödvändiga för oberoende liv.
* virus: Dessa anses vara icke-levande enheter av många, som finns någonstans mellan levande och icke-levande. De är obligatoriska intracellulära parasiter, vilket innebär att de kräver en värdcell för att replikera. Medan de har genetiskt material (DNA eller RNA), har de inte sina egna ribosomer eller metaboliska maskiner. Därför ingår de inte i systemet med tre domäner.
* viroider: Dessa är ännu enklare än virus, som endast består av en kort cirkulär RNA -molekyl utan proteinbeläggning. Liksom virus är de obligatoriska parasiter och passar inte in i systemet med tre domäner.
* Prions: Dessa är smittsamma proteiner. De är felfoldade proteiner som kan inducera andra proteiner att felfoldas, vilket leder till sjukdom. De saknar helt nukleinsyror och anses inte heller vara en del av systemet med tre domäner. De är helt enkelt avvikande proteiner.
