YouTube använder inte ett enda filformat. De använder olika format beroende på videoklippet, bitrate och codec och serverar ofta olika format till olika enheter för att optimera uppspelningen. De underliggande videon och ljudkodeks är emellertid vanligtvis variationer av MP4 (som är ett containerformat, inte en codec själv), ofta med H.264 eller H.265 (för video) och AAC (för ljud). VP9 är också allt vanligare.